凡例九條

一 、 素問內經 ， 乃軒岐明道之書 ， 開物成務 ， 醫道始昌 。 雖秦煽毒 ， 而醫書獨全 。 後之注者 ， 或割裂全文 ， 或刪改字句 。 剽竊詭道 ， 實開罪於先聖 。 如靈素合刻 ， 篡集類經是已 。 惟王太僕 、 馬元臺 、 張隱菴註釋 ， 俱屬全文 。 然字句文義 ， 有重複而不作衍文者 ， 有倒置而未經改正者 ， 有以訛傳訛而弗加詳察者 。 余細為考校 ， 確參訂正 ， 庶幾補聖經 ， 下禪後學 。

二 、 六經文史 ， 歷代有□卿大儒互參考訂 ， 奕世宗仰 。 至醫門經論 ， 未得名儒碩士繙閱鋟梓 ， 故茫無徵信 ， 即 《 素問 》 一經 ， 各家雖有註釋 ， 余詳觀之 ， 非苟簡隙漏 ， 即敷淺不經 。 隱菴集註 ， 義意艱深 ， 其失也晦 。 余不得已而更注之 ， 顏曰 「 直解 」， 世之識者尚其鑑諸 。

三 、 隱菴先生有集註之刻 ， 不便雷同 ， 故曰 「 直解 」。 註釋直捷明白 ， 可合正文誦讀 ， 非如張太岳 《 四書直解 》， 其訓詁有不可讀者 。

四 、《 素問 》 八十一篇 ， 原遺闕二篇 ， 今已搜補矣 。 每篇名目 ， 俱當詮解 ， 茲刻不第詮解篇名 ， 即篇中大旨亦逐為指出 。 一篇之中 ， 分為數節 ， 蓋以詞論冗繁 ， 略分節旨 ， 使觀者易於領會耳 。

五 、 軒岐 《 素問 》 謂之聖經 ， 不容假借 ， 無奈後人著作方書 ， 偏剿襲其義 ， 摘取其文 ， 而經脈針刺之理 、 三才運氣之道 ， 茫乎若迷 ， 鳴呼 ！ 世如斯 、 醫如斯 ， 學道者又如斯 ， 則經幾晦於方技 ， 將見素問內經徒寄空名於天壤耳 ！ 後之業是道者 ， 當知篇章字句 ， 皆屬珠璣 ， 毋容稍為去取者也 。

六 、 是注體會先聖微意 ， 言言中的 ， 字字見解 ， 而一針一血 ， 尤必深入淺出 ， 俾千百世後 ， 永為畫定不易之說 ， 庶軒岐問答之神 ， 躍躍紙上 ， 而至精至微之理 ， 炳若日星 。 然道非淺近 ， 故本注云 ： 非其人勿授 、 非其真傳不傳 。 余之勞心神 、 歷寒暑 ， 以成此解 ， 亦第藏之名山 ， 傳之其人而已 ， 此復何計哉 。

七 、《 素問 》 註解 ， 不下十餘家 ， 余多方購覽 ， 而明顯入彀者 ， 十不得一 。 然世之學者 ， 便知諸刻紛壇 ， 其中是非莫辨 、 真偽難分 ， 余豈能執余注而告諸人曰 ： 余解是真也 ， 非偽也 。 噫 ！ 必不能矣 ！ 所以雖付剞劂 ， 要亦信諸吾心 ， 質之軒岐 ， 不冀人之知也 。 雖然 ， 人同此心 ， 心同此理 ， 倘後之君子 ， 或嗣而續之 ， 倡而明之 ， 又余之深幸也夫 。

八 、《 素問 》 論人身陰陽 、 血氣 ， 臟腑 、 經脈 ， 而無治病之法 ， 是以數千年來 ， 醫家咸置不問 ， 蓋意理精深 ， 無從控討 。 是解則理明義達 ， 不冗不漏 。 然必誠切研求 ， 潛心會悟 ， 始能得其旨趣 。 昔者 ， 余著 《 傷寒集註 》， 梓以問世 ， 亦可謂理明義達 ， 不冗不漏矣 ， 而研求會悟 ， 似鮮其人 ， 因思 《 素問 》 之書 ， 亦猶是也 。 言念及此 ， 良可悲已 。

九 、《 素問直解 》 外 ， 更有 《 本草崇原 》、《 靈樞直解 》、《 金匱集註 》 聖經賢論剞劂告竣 。 尤有 《 醫學真傳 》 之梓 ， 蓋本神農 、 黃帝 、 仲景諸書 ， 而詳明識證施治 、 品方用藥之法也 。 余嘗謂聖賢經論 ， 猶布帛菽粟 ， 布帛禦寒而必為之衣 ， 菽粟救飢而必為之食 。《 醫學真傳 》 亦為衣而使人可衣 ， 為食而令人可食也 。 然必經論俱成而後梓也 ， 姑有待也 。